2006年建的无证房是否违建需政府调查认定。根据《城乡规划法》等，政府应组织调查无证房性质，违建则不予补偿，非违建应补偿。未及时处理可能导致权益受损或面临强制拆除。
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无证房需调查认定。1. 若政府认定违建：按法律程序接受处理，或提起诉讼维权。2. 若政府未认定违建：与政府协商补偿，明确补偿标准和方式；若协商不成，可寻求法律援助或提起诉讼。
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处理无证房常见方式为调查认定和协商补偿。若房屋被认定为违建，需按法律程序处理；若非违建，应与政府协商补偿事宜，根据房屋实际情况选择合适处理方式。